合同会社が売上なしでも払う税金とは?赤字(利益ゼロ)の場合の納税について解説

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公開日:2025年8月

更新日:2025年8月15日

合同会社を経営していると、会社設立初年度や景気の変動、業種特有の事情によって売上なしの年度が発生することは珍しくありません。しかし、売上なしの状態であっても、合同会社には必ず発生する税金があり、赤字(利益ゼロ)だからといって税金がゼロになるわけではありません。

実際、合同会社では、売上なしでも法人住民税の均等割や固定資産税、自動車税・自動車重量税、印紙税などの税金が発生するケースがあります。これらの税金は、売上や利益に関係なく合同会社が負担しなければならない固定的な費用であり、資金繰りに大きな影響を与えることもあります。

この記事では、売上なしの合同会社が支払うことになる可能性のある税金の種類や計算方法、赤字(利益ゼロ)でも避けられない税金の仕組みについて徹底解説します。

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目次

  1. 合同会社が支払うべき税金|売上なしでも発生する税金に注意
    1. 合同会社で発生する税金①
      法人税と地方法人税|売上なしでも申告義務あり
    2. 合同会社で発生する税金②
      法人事業税と特別法人事業税|売上なしなら課税ゼロだが申告必要
    3. 合同会社で発生する税金③
      法人住民税(均等割と法人税割)|売上なしでも必ず発生
    4. 合同会社で発生する税金④
      消費税|売上なしでもインボイス登録で発生の可能性
    5. 合同会社で発生する税金⑤
      固定資産税・償却資産税|売上なしでも資産があれば課税
    6. 合同会社で発生する税金⑥
      自動車税・印紙税|売上なしでも所有や契約で発生
    7. 合同会社で発生する税金⑦
      源泉所得税と住民税(従業員・役員がいる場合)
  2. 売上なしでも合同会社にかかる税金|赤字でも避けられない税金の種類
    1. 法人住民税(均等割)|売上なしでも必ず発生する合同会社の税金
    2. 固定資産税|売上なしの合同会社でも不動産保有でかかる税金
    3. 自動車税・自動車重量税|売上なしでも車所有で必ず発生する税金
    4. 印紙税|売上なしでも契約や取引で発生する税金
  3. 売上なしの合同会社にかからない可能性がある税金とは?
    1. 法人税|売上なし・所得なしなら課税ゼロ
    2. 法人住民税の法人税割|売上なしなら課税ゼロだが均等割は別
    3. 法人事業税|売上なしなら発生しないが例外あり
    4. 消費税・地方消費税|売上なしでも資産売却時は注意
  4. 売上なしの合同会社が抱えるデメリットと資金調達の方法
    1. 売上なしの合同会社は世間的信用が低下し税金負担とのバランスが課題
    2. 売上なしの合同会社が使える資金調達方法
  5. まとめ|合同会社は売上なしでも税金が発生

合同会社が支払うべき税金|売上なしでも発生する税金に注意

合同会社は株式会社と同様に法人格を持つため、売上なしの状態でも必ず発生する税金があります。合同会社は出資者が経営に直接関与できる柔軟な会社形態ですが、法人である以上、国税や地方税などの税金の対象となります。ここでは、合同会社が支払うべき税金を、売上なしの場合でも分かるように解説します。

合同会社で発生する税金①
法人税と地方法人税|売上なしでも申告義務あり

法人税は、合同会社の事業活動で得た所得に課される国税で、本業以外の利益(不動産売却や金融収入など)も課税対象です。

「合同会社が売上なしでも払う税金」編集部

税金額は以下の計算式で求められます。

課税所得額 × 法人税率 − 控除額

資本金1億円以下の合同会社では、課税所得800万円以下の部分は15%、それを超える部分は23.2%となります。売上なしで赤字決算なら法人税額はゼロになることもありますが、税金の申告義務は必ず残ります。

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地方法人税は法人税額の10.3%を上乗せして税金額が計算され、国から地方自治体へ配分されます。売上なしでも法人税の計算結果がゼロなら地方法人税もゼロですが、やはり税金の申告は必要です。

「合同会社が売上なしでも払う税金」編集部

合同会社が売上なしでも支払う税金の種類について以下のサイトも是非ご覧ください。
合同会社で収入なし期間を乗り切る!税金対策と資金繰りのすべて

合同会社で発生する税金②
法人事業税と特別法人事業税|売上なしなら課税ゼロだが申告必要

法人事業税は、法人の所得に応じて都道府県に納める地方税(税金)です。公共サービスの利用に対する負担金としての性質を持ちます。合同会社が売上なしで赤字の場合は法人事業税額はゼロですが、税金の申告自体は必要です。

合同会社が売上なしでも払う税金に関するポイント!

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特別法人事業税は、法人事業税と同時に徴収される国税で、地域間の財政格差を是正する目的があります。売上なしでも所得があれば税金が課されます。

合同会社で発生する税金③
法人住民税(均等割と法人税割)|売上なしでも必ず発生

法人住民税は、合同会社が登記している都道府県や市区町村に納める地方税(税金)で、売上なしでも課税される税金です。法人住民税には以下の2つがあります。

合同会社が売上なしでも払う税金に関するおすすめ記事

税理士_依頼_おすすめの記事

合同会社が売上なしの赤字であっても支払う必要がある税金の種類について、以下の記事も是非参考にしてください。

合同会社が売上なしでも払う税金の参考記事:「売上なしの合同会社にかかる税金とかからない税金は?売上なしでも決算は不要にならない

  • 法人税割:法人税額を基準に計算(売上なしならゼロ)
  • 均等割:資本金や従業員数に応じて一定額が発生(売上なしでも必ず課税)

均等割は最低でも年間7万円前後(自治体により異なる)が必要で、売上なしの合同会社でも避けられない税金です。

合同会社で発生する税金④
消費税|売上なしでもインボイス登録で発生の可能性

「合同会社が売上なしでも払う税金」編集部

消費税は、商品・サービスの提供時に消費者から預かる税金です。合同会社が課税事業者になる条件は以下の通りです。

  • 基準期間の課税売上高が1,000万円超
  • 特定期間の課税売上高+給与等支払額の合計が1,000万円超
  • 適格請求書発行事業者(インボイス登録事業者)

原則として、合同会社設立2期目までは免税(税金が課されない)ですが、インボイス登録をしている合同会社は、売上なしでも消費税の納税義務が発生する場合があります。

合同会社で発生する税金⑤
固定資産税・償却資産税|売上なしでも資産があれば課税

合同会社が土地や建物を所有していれば固定資産税という税金が発生します。さらに、パソコンや機械設備などの償却資産で課税標準額が150万円以上あれば合同会社にも償却資産税が課税されます。これらの税金は売上なしの合同会社でも資産を保有していれば税金がかかります。

合同会社で発生する税金⑥
自動車税・印紙税|売上なしでも所有や契約で発生

合同会社が車を所有していれば売上なしでも自動車税(軽自動車税)が毎年発生します。契約書や領収書などの作成時には印紙税も必要です。

合同会社が売上なしでも払う税金に関する注意点

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        _依頼_おすすめの注意点

合同会社で売上なしでも、契約や資産保有で税金が発生することに注意が必要です。

合同会社で発生する税金⑦
源泉所得税と住民税(従業員・役員がいる場合)

合同会社が従業員や役員に給与・報酬を支払う場合は、所得税や住民税などの税金を源泉徴収して納める義務があります。売上なしでも役員報酬を支払っていれば源泉徴収は必須です。

合わせて読みたい「消費税の申告義務」に関するおすすめ記事

消費税申告義務の対象となる条件とは?計算方法や課税事業者と免税事業者の違いも解説!

本記事では、消費税申告義務の対象となる条件を徹底的に解説するとともに、消費税申告義務を負う課税事業者と、申告義務が免除される免税事業者の違いについても詳しくご紹介します。

売上なしでも合同会社にかかる税金|赤字でも避けられない税金の種類

合同会社を経営していると、会社設立初年度や景気変動、業種の特性によって売上なしの年度が発生することがあります。しかし、売上なしの合同会社であっても、必ず発生する税金が存在します。これらの税金は赤字でも免除されるわけではなく、確定申告や納付の義務があります。長期的に合同会社を運営するなら、売上なしの年度でも発生する税金を正確に理解しておくことが重要です。

合同会社が売上なしでも払う税金に関するおすすめ記事

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合同会社が売上なしの赤字であっても支払う必要がある税金の種類について、以下の記事も是非参考にしてください。
合同会社の決算・法人税等の確定申告方法!自分で可能?いつ行う?

法人住民税(均等割)|売上なしでも必ず発生する合同会社の税金

法人住民税は、合同会社が所在地の自治体に対して支払う税金で、「法人税割」と「均等割」で構成されます。法人税割は法人税額を基準に計算されるため、売上なしで法人税額がゼロなら課税されませんが、均等割は売上や利益に関係なく必ず税金が発生します。

「合同会社が売上なしでも払う税金」編集部

合同会社が売上なしでも支払う税金の種類について以下のサイトも是非ご覧ください。

合同会社が売上なしでも払う税金の参考記事:「合同会社で売上なしでも納める税金|決算や確定申告の必要性も解説

均等割の税金額は資本金や従業員数に応じて決まり、資本金1,000万円以下の合同会社なら、都道府県民税20,000円、市町村民税は従業員数によって50,000円または120,000円となります。つまり売上なしでも、この税金は必ず支払わなければなりません。

合同会社が売上なしでも払う税金に関するポイント!

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納付方法は自治体から送付される税金の納付書による支払いや、オンライン納付などがあり、売上なしの年度でも合同会社は確実に納税義務を果たす必要があります。

固定資産税|売上なしの合同会社でも不動産保有でかかる税金

合同会社が土地や建物などの不動産を所有している場合、売上なしでも固定資産税が毎年課税されます。この合同会社の税金は毎年1月1日の所有状況を基準に算定され、評価額に基づいて計算されます。

固定資産税として納められた税金は、道路整備や公共施設の運営、介護・福祉サービスなど、地域社会のインフラ整備に使われます。売上なしでも不動産を所有していれば必ず課税されるため、事務所を購入するか賃貸にするかを検討する際には、この税金の負担も考慮することが必要です。

合同会社が売上なしでも払う税金に関するおすすめ記事

税理士_依頼_おすすめの記事

合同会社が売上なしの赤字であっても支払う必要がある税金の種類について、以下の記事も是非参考にしてください。

合同会社が売上なしでも払う税金の参考記事:「売上なしでも税金はかかる?合同会社や株式会社が負担する税金を紹介

自動車税・自動車重量税|売上なしでも車所有で必ず発生する税金

合同会社が社用車を所有していれば、売上なしでも自動車税や自動車重量税が課せられます。自動車税は車の排気量や所有年数に応じて金額が決まり、古い車は税金額が高くなる場合があります。自動車重量税は車両重量によって異なり、新規登録や車検時に数年分をまとめて納付します。

合同会社が売上なしでも払う税金に関する注意点

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都市部で公共交通機関が充実している場合、車を所有せず経費や税金を削減する選択もありますが、地方では車が必須となることが多く、売上なしの年度でも車両を所有していれば必ず税金が発生します。

印紙税|売上なしでも契約や取引で発生する税金

合同会社が契約書や領収書を発行する場合、内容や金額に応じて印紙税が発生します。印紙税の対象となる書類は、不動産売買契約書、請負契約書、金銭消費貸借契約書、運送契約書など多岐にわたります。

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合同会社が売上なしでも支払う税金の種類について以下のサイトも是非ご覧ください。
合同会社の決算は自分でできる?自分でするデメリットとスムーズにするやり方

特に領収書では、5万円を超える金額を受け取った場合には収入印紙を貼る必要があります。売上なしでも、資産売却や金融取引などで契約書を作成すれば税金が発生します。どの契約書に印紙が必要か判断が難しい場合は、税理士などの専門家に確認すると安心です。

売上なしの合同会社にかからない可能性がある税金とは?

合同会社は法人である以上、さまざまな税金の申告義務がありますが、売上なしの状態であれば、実際には課されない種類の税金も存在します。

「合同会社が売上なしでも払う税金」編集部

ここでは、売上がない合同会社において発生しない可能性がある主な税金と、その仕組みを詳しく解説します。

法人税|売上なし・所得なしなら課税ゼロ

法人税は、合同会社の事業活動によって得られた「所得」に対して課される税金です。したがって、売上なしで赤字決算の場合、法人税額はゼロとなります。

合同会社が売上なしでも払う税金に関する注意点

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ただし注意すべきは、事業の売上がゼロでも、資産の売却や保険金収入などによって一時的な利益が発生すれば、その分に法人税が課される可能性があることです。

さらに、法人税額がゼロでも税金の申告義務は免除されません。合同会社が売上なしだからといって決算・申告を怠れば、加算税や延滞税といったペナルティが発生します。赤字・無収入でも、決算と法人税の申告は必ず行う必要があります。

法人住民税の法人税割|売上なしなら課税ゼロだが均等割は別

法人住民税は「均等割」と「法人税割」の2つの税金で構成されています。このうち、法人税割は法人税額をもとに税金額を計算されるため、法人税がゼロであれば法人税割もゼロです。
しかし、売上なしでも均等割は必ず発生し、合同会社の場合でも資本金や従業員数に応じて最低7万円前後の負担が必要です。

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合同会社が売上なしでも払う税金に関するポイント!

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法人住民税は、合同会社が所在する都道府県や市町村に申告・納付します。売上なし・所得なしで法人税割がゼロでも、申告を忘れると罰則の対象となります。

法人事業税|売上なしなら発生しないが例外あり

法人事業税は、法人の所得に課税される地方税で、合同会社も対象となります。資本金1億円以下の中小規模の合同会社で、売上なし・赤字で所得ゼロの場合は、法人事業税も発生しません。

合同会社が売上なしでも払う税金に関するおすすめ記事

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合同会社が売上なしの赤字であっても支払う必要がある税金の種類について、以下の記事も是非参考にしてください。
合同会社で収入なしでも大丈夫?運営のポイントと注意点

ただし例外として、資本金が1億円を超える大規模法人には「外形標準課税」が適用されます。この外形標準課税は、所得だけでなく人件費・支払利息・資本金額といった要素にも基づいて課税されるため、売上なしでも税金が発生する可能性があります。

消費税・地方消費税|売上なしでも資産売却時は注意

消費税および地方消費税は、通常は課税売上高が発生してはじめて納税義務が生じます。売上なしであれば基本的に消費税額はゼロですが、固定資産や事業用不動産を売却した場合には大きな消費税負担が発生することがあります。

合同会社が売上なしでも払う税金に関する注意点

税理士
        _依頼_おすすめの注意点

たとえば、売上なしの合同会社でも事務所ビルを売却すれば、その譲渡対価に対して消費税が課税されます。このため、資産売却を行う際は、事前に消費税だけでなく他の税金も含めた試算が必要です。

「合同会社が売上なしでも払う税金」編集部

合同会社が売上なしでも支払う税金の種類について以下のサイトも是非ご覧ください。

合同会社が売上なしでも払う税金の参考記事:「合同会社が赤字になった場合の税金はどうなる?納税の有無を解説

売上なしの合同会社は、所得に連動する税金(法人税・法人事業税・法人住民税の法人税割・消費税など)はゼロになる可能性が高いものの、均等割や資産課税など一部の税金は必ず発生します。
「売上なし=税金ゼロ」という誤解は危険であり、適切な申告と税務管理が不可欠です。特に資産売却やインボイス登録の有無によって、思わぬ税金が発生するケースがあるため、売上ゼロ期間でも税務対応を怠らないことが重要です。

売上なしの合同会社が抱えるデメリットと資金調達の方法

売上なしの状態が続く合同会社にとって、最も大きなデメリットは「融資による資金調達が難しくなる」という点です。合同会社の経営では、事業を安定して継続するために資金調達は欠かせませんが、売上なしだと返済能力を証明できず、金融機関の融資審査で不利になります。特に銀行などの民間金融機関は売上や利益実績を重視するため、売上なしの合同会社は審査通過のハードルが高くなります。税金負担は売上なしの場合に軽くなる一面がありますが、経営全体で見れば信用力低下という大きなリスクを抱えることになります。

合同会社が売上なしでも払う税金に関するおすすめ記事

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合同会社が売上なしの赤字であっても支払う必要がある税金の種類について、以下の記事も是非参考にしてください。

合同会社が売上なしでも払う税金の参考記事:「合同会社の売上がなしの場合に確定申告で支払う税金

売上なしの合同会社は世間的信用が低下し税金負担とのバランスが課題

売上なしの合同会社は、税制上は法人税や法人事業税がゼロになる可能性があり、税金負担は軽減されます。

「合同会社が売上なしでも払う税金」編集部

しかし、法人住民税の均等割や固定資産税、自動車税、印紙税といった税金は売上なしでも必ず発生します。

さらに、売上なしの状態は外部から「経営が安定していない」と見られ、取引先や金融機関からの信頼度が低下します。この結果、事業資金が必要になったときに融資を受けることが難しくなり、資金繰りの選択肢が限られます。

売上なしの合同会社が使える資金調達方法

売上なしの合同会社が使える資金調達方法①
資本金から資金を捻出

合同会社設立時に入金した資本金は、経営の維持や事業の支出、税金の支払いにも利用できます。売上なしの状態で急な支出や税金納付が必要になった場合でも、資本金を事業資金として活用できます。ただし、資本金を使い切れば経営の安全性が下がるため、計画的な使用が求められます。

「合同会社が売上なしでも払う税金」編集部

合同会社が売上なしでも支払う税金の種類について以下のサイトも是非ご覧ください。

合同会社が売上なしでも払う税金の参考記事:「合同会社|売上なしでも負担する7つの税金

売上なしの合同会社が使える資金調達方法②
日本政策金融公庫からの融資

売上なしの合同会社でも利用可能な制度が、日本政策金融公庫による創業融資です。

「合同会社が売上なしでも払う税金」編集部

国が運営するため、設立間もない合同会社でも申し込みが可能で、場合によっては売上なしでも融資が通ることがあります。

ただし、審査は厳しく、事業計画書・収支予算書・決算書などの提出が必須です。税理士や専門家に依頼して内容を精緻化すれば、売上なしでも融資成功の可能性が高まります。

売上なしの合同会社が使える資金調達方法③
補助金・助成金制度の活用

国や自治体が行う補助金・助成金制度は、売上なしの合同会社でも申請可能なものがあります。補助金は新規事業や地域活性化を目的とし、助成金は雇用や労働環境の改善を目的としています。

これらは返済不要の資金で、税金負担を軽減しながら事業を拡大できるメリットがあります。

合同会社が売上なしでも払う税金に関するおすすめ記事

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合同会社が売上なしの赤字であっても支払う必要がある税金の種類について、以下の記事も是非参考にしてください。

合同会社が売上なしでも払う税金の参考記事:「会社の売上ゼロでもかかる税金がある!?会社を「休眠」させるときの注意点などを解説

ただし、採択されるには明確で独自性のある事業計画が必要で、募集枠や期限も限られます。

まとめ|合同会社は売上なしでも税金が発生

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合同会社は、たとえ売上なしや赤字(利益ゼロ)の年度であっても、必ず発生する税金があります。特に法人住民税の均等割は、売上や利益の有無にかかわらず合同会社が毎年納めなければならない税金であり、資本金や従業員数によって金額が変わります。さらに、合同会社が不動産を所有していれば固定資産税、車両を所有していれば自動車税や自動車重量税、契約書や領収書を発行すれば印紙税といった税金が発生します。これらの税金は、事業の売上がゼロであっても必ず負担する必要があり、経営が厳しい年度においても資金繰りに影響を与える要因となります。

また、合同会社は売上なしでも確定申告や決算申告を行う義務があり、申告を怠ると加算税や延滞税などのペナルティが課される可能性があります。「売上なし=税金ゼロ」という誤解を持ってしまうと、資金計画や納税準備が不十分になり、後から予期せぬ税金負担に直面する危険があります。

そのため、合同会社を長期的に安定運営するためには、売上なしでも発生する税金の種類を正しく理解し、毎年の予算や資金繰り計画に組み込むことが欠かせません。法人住民税の均等割や固定資産税、自動車税・自動車重量税、印紙税などは、合同会社が事業を継続する限り避けられない税金です。経営者は、売上がゼロの年度であっても確実に納税できるよう、日頃から税金の支払いを想定した資金管理を徹底する必要があります。

最終的に、合同会社は売上なしの年度でも税金負担がゼロになることはなく、赤字や利益ゼロの状況でも一定の税金を支払い続ける義務があります。売上なしの年度こそ、税金の知識と資金準備が経営を守る大きな武器となるのです。

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